<form id="qrl5w"></form><tr id="qrl5w"><tt id="qrl5w"></tt></tr>

    <form id="qrl5w"></form>

      <form id="qrl5w"></form>
    1. <nav id="qrl5w"><listing id="qrl5w"></listing></nav>

          <wbr id="qrl5w"><legend id="qrl5w"></legend></wbr>

          <form id="qrl5w"><th id="qrl5w"><track id="qrl5w"></track></th></form>
        1. <wbr id="qrl5w"></wbr>
          歡迎進入上海云序生物科技有限公司官方網站!?? 生物在線????丁香通

          服務熱線 021-64878766

          首頁 > 服務與產品 > microRNA研究

          microRNA研究
          外泌體miRNA測序
          日期:2019年07月15日    來源:云序生物
          技術簡介

          外泌體(Exosomes)是一種直徑在40~100 nm的圓形單層膜結構,是細胞外泌囊泡中體積較小的一種。外泌體可被大多數細胞分泌,并分布于唾液、血漿、乳汁、尿液等體液中。外泌體中不僅包含蛋白質成分,還包括一些RNA成分,如微小RNA ( microRNA,miRNA)、長鏈非編碼RNA和mRNA、環狀RNA(circular RNA,circRNA)。外泌體所攜帶的這些RNA統稱為外泌體來源RNA,具有完整的序列結構和生物活性。外泌體中大約含幾百種miRNAs,通過外泌體miRNA測序,研究人員可獲得與疾病相關的遺傳特征(生物標志物),為將來腫 瘤治 療領域通過液體活檢來尋找有效藥 物。

          外泌體

          云序優勢

          一站式服務

          客戶只需提供細胞上清、血清、血漿、外泌體RNA,云序生物提為您完成樣品準備,文庫制備,上機測序到數據分析的整套服務。

          商業化試劑盒抽提外泌體

          云序生物使用成熟的商業化試劑盒抽提外泌體,極大改善樣品的均一性。客戶可選擇從外泌體到RNA測序一步流程法,也可選擇先提取外泌體,在由外泌體抽取RNA兩步流程法。

          特異性富集miRNA片段

          特異性富集和檢測miRNA,miRNA有效數據高于其它公司提供的常規small RNA測序服務。

          專業的生物信息學分析

          云序生物具有強大的生物信息學團隊,能夠滿足客戶對數據各類深入的分析要求。

          樣本要求

          樣品類型:

          細胞、體液或RNA樣品。其它類型樣品請詳詢。

          樣品量:

          a) 細胞 2×107

          b) 組織 100 mg 

          c) 體液 全血、血清、血漿 5 mL  

          腦脊液 5 mL  

          尿液  100 mL

          d) 總RNA 2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5,無明顯降解,電泳檢測樣品特征性條帶完整清晰,無明顯彌散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7)

          樣品運輸及保存:

          樣品運輸:樣品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰運輸 

          樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成5-10 mg的小塊),可用TRIZOL或RNA保護劑處理,液氮凍存后,-80℃保存,RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存,樣品保存期間避免反復凍融。

          數據分析(下列有※表示個性化分析)

          1、差異miRNA篩選與聚類篩選

          兩組或多組樣品間的差異表達miRNA(Fold Change≥2, P值≤ 0.05)

          注:Fold Change代 表差異程度,P值代 表差異的明顯性,篩選中采用的倍數變化會根據具體數據情況進行調整。

          差異miRNA篩選與聚類篩選

          2、miRNA靶基因預測
          云序生物整合了TargetScan、mirBase、miRanda等權威miRNA靶基因預測軟件,提供嚴謹可靠的靶基因預測數據,通過軟件預測miRNA的靶基因,從而推測miRNA的生物學功能。


          miRNA靶基因預測


          3、miRNA靶基因網絡
          構建miRNA靶基因網絡。

          miRNA靶基因網絡

          4、miRNA靶基因GO和信號通路分析
          對miRNA的靶基因進行GO和信號通路分析,從而幫助推斷miRNA的生物學功能。

          miRNA靶基因GO和信號通路分析


          5、miRNA-靶基因GO或靶基因通路網絡分析
          利用miRNA靶基因及靶基因GO或信號通路分析,構建網絡圖,通過網絡圖可發現核 心miRNA以及miRNA調控的核 心基因功能。

          miRNA-靶基因GO或靶基因通路網絡分析

          6、miRNA上游轉錄因子分析
          預測特定miRNA上游的轉錄因子結合位點,幫助推斷該miRNA的調控機制。

          miRNA上游轉錄因子分析

          7、新miRNA預測(脊椎動物)
          預測尚未被發現的新miRNA。


          新miRNA預測(脊椎動物)

          案例解析

          案例1:脂肪組織巨噬細胞分泌外泌體miRNA可改善體內胰島素敏感性

          原文:Adipose Tissue Macrophage-Derived Exosomal miRNAs Can Modulate In Vivo and In Vitro Insulin Sensitivity

          期刊:Cell 影響因子:30.41

          外泌體中包含多種miRNA,調控靶細胞生理活性,本文發現脂肪組織巨噬細胞(adipose tissue macrophages,ATMs)分泌的外泌體中含有miRNA并可以轉移到胰島素的靶細胞中,從而調節靶細胞對胰島素的敏感性以及體內的總糖代謝穩態。Olefsky團隊從肥胖小鼠脂肪組織內分離出巨噬細胞,再收集細胞里的外泌體,用它們處理體型瘦的健康小鼠,發現接受了外源外泌體的小鼠雖然體重依然正常,但卻出現肥胖誘導型胰島素抵抗癥狀。相反,提取瘦小鼠來源的脂肪組織巨噬細胞外泌體,并用它在肥胖小鼠上治 療,會大幅改善體內和體外的葡萄糖耐受和胰島素敏感性。研究人員證明miR-155是肥胖個體脂肪組織巨噬細胞外泌體差異表達的miRNA之一,miR-155極有可能直接通過抑 制其靶基因PPARγ來抑 制胰島素信號傳導和葡萄糖耐受。


           肥胖導致miRNA表達譜的變化

          圖1. 肥胖導致miRNA表達譜的變化

          案例2:血液外泌體miRNA作為非小細胞ai分子標志物分析

          原文:Evaluation of tumor-derived exosomal miRNA as potential diagnostic biomarkers for early stage non-small-cell lung cancer using next-generationsequencing

          期刊:Clinical Cancer Reserach 影響因子:8.78

          本文發現腺ai(AC)和鱗ai(SCC)患者的血漿可分離出腫 瘤來源外泌體,其中外泌體miRNA極有希望用于NSCLC早期預測和診斷。文章利用miRNA-seq對46個I期NSCLC患者和42個健康個體的外泌體進行miRNA分析,以鑒定和驗證AC和SCC的特異性表達miRNA。結果表明,miR-181-5P、miR-30a-3p、miR-30e-3p和miR-361-5p為AC特異性的;miR-10b-5p、miR-15b-5p和miR-320b為SCC特異性的。后續繪制ROC曲線預測評估三種組合miRNA疾病相關性。事實證明這些miRNA有極大潛力成為NSCLC早期診斷生物標志物。


          正常人與腺ai與鱗ai患者miRNA表達情況相關系數圖

          圖2. 正常人與腺ai與鱗ai患者miRNA表達情況相關系數圖


          SDWliqubLk2Zmy4N0DMRG4g+oI4b0q944OBNIdkpjVTR0OiWov4aH3DzZDdD2sRx/CR2CMETcUJ79HQ43ssHJInHpy50xr7ZtGN3jB6XXgp6PlniAOJJtLaj44D0KNpwV80Dlj9+3Wk= 色情最新电影免费观看的网站,最新国自产拍天天更新,97大香伊蕉国产,红色一片一片的视频,亚洲国产精品无码中文字