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          eccDNA(環狀DNA)測序
          A&A Bio的環狀DNA純化柱

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          環狀DNA簡介
          游離于染色體基因組之外的DNA (extrachromosomal DNA,ecDNA)被發現常常以環狀的形式存在,這種形式的DNA被稱為環狀DNA (extrachromosomal circular DNA,eccDNA)。目前也習慣將巨大的環狀DNA(>1Mb)稱為ecDNA, 而將相對較小的環狀DNA稱為eccDNA。
          傳統觀點認為真核基因組通常形成穩定的線性染色體。但最新的研究表明:無論是在正常體細胞還是癌細胞中,都存在大量染色體外環狀DNA。近日,Nature雜志上發表了顛覆性研究成果:在腫瘤中,主要的癌基因轉錄本是直接來自于環狀DNA的,而環狀DNA的染色質是高度開放的,環狀DNA的癌基因能夠大量表達,同時缺乏絲粒,導致不遵照孟德爾定律進行遺傳,這種特性使得環狀DNA是驅動腫瘤異質性的重要機制。由此可見,由于其結構和表達的特異性,環狀DNA可以影響細胞生命活動,促進腫瘤細胞演進和適應性進化,增加了基因組的可塑性和不穩定性。目前,環狀DNA不僅僅可以作為一種新型特異的腫瘤標志物,還在腫瘤發生發展機理研究中發揮著重大的潛在價值。可以預見的是,環狀DNA將迅速成為新的科研熱點,甚至會對傳統遺傳學和基因組學帶來革命性影響。

          環狀DNA示意圖
          環狀DNA示意圖

          A&A Bio的環狀DNA純化柱技術簡介
          研究組織、細胞的環狀DNA測序常用Circle-seq技術,Circle-seq測序中就包含柱純化去除線性DNA,具體步驟是柱純化去除基因組DNA、外切酶對柱純化后產物進行酶消化、滾環擴增放大環狀DNA信號以及最后建庫測序。因此,相對于大量存在的基因組DNA,環狀DNA在細胞中的含量非常少,所以從樣品中提取總DNA后,第一步需要通過柱純化去除基因組DNA,以免測序中基因組DNA占據大部分數據量。柱純化這一步驟十分關鍵,既要最大限度地去除基因組DNA, 又需最大限度保留環狀DNA分子,尤其是避免丟失掉超長和超短的環狀DNA。云序生物采用A&A Biotechnology的純化柱,是絕大部分環狀DNA高分文章中所使用的純化柱,并且云序生物是該品牌在國內的唯一總代理。
          A&A Bio的環狀DNA純化柱


          云序優勢

          唯一總代理:
          云序生物是A&A Biotechnology在國內的唯一總代理。
          純化效率高:
          最大限度去除基因組DNA, 又最大限度保留了環狀DNA。

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